Экзонуклеазный домен второй эпсилон субъединицы ДНК-полимеразы III бактерии E.coli (Exonuclease domain of the 2 epsilon subunit of E.coli DNA polymerase III)

На главную страницу семестра

  1. Краткое название белка: DPO3E_ECOLI
  2. Полное название организма: Escherichia coli,K-12
  3. Название гена: dnaQ
  4. Номер локуса в бактериальной хромосоме: b0215
  5. Последовательность в формате FASTA: 

    >DPO3E_ECOLI Exonuclease domain of the 2 epsilon subunit of E.coli DNA polymerase III
MSTAITRQIVLDTETTGMNQIGAHYEGHKIIEIGAVEVVNRRLTGNNFHVYLKPDRLVDPEAFGV
HGIADEFLLDKPTFAEVADEFMDYIRGAELVIHNAAFDIGFMDYEFSLLKRDIPKTNTFCKVTDS
LAVARKMFPGKRNSLDALCARYEIDNSKRTLHGALLDAQILAEVYLAMTGGQTSMAFAMEGETQQ
QQGEATIQRIVRQASKLRVVFATDEEIAAHEARLDLVQKKGGSCLWRA

Мои вычисления с помощью Excel

Аминокислотный состав %
A(Аланин) 9,49
C(Цистеин) 1,16
D(Аспарагиновая кислота)5,16
E(Глутаминовая кислота) 5,75
F(Фенилаланин) 3,89
G(Глицин) 7,39
H(Гистидин) 2,25
I(Изолейцин) 6,01
K(Лизин) 4,4
L(Лейцин) 10,64
M(Метионин) 2,79
N(Аспарагин) 3,97
P(Пролин) 4,43
Q(Глутамин) 4,43
R(Аргнин) 5,51
S(Серин) 5,85
T(Треонин) 5,41
V(Валин) 7,08
W(Триптофан) 1,52
Y(Тирозин) 2,86



  1.   Длина последовательности: 243 а.о.

  2.   Молярная масса: 27102,53 г/моль.

  3.   Средний заряд молекулы:

  4.       при рН=7,0 -0,2

  5.       при рН=1,0: +33,96

      Отношение содержания гидрофобных остатков (Ala,Cys,Ile,Leu,Met,Phe,Val)

      к содержанию гидрофильных (Arg,Asn,Asp,Gln,Glu,His,Lys,Ser): 1,084;

      это позволяет думать, что данный белок не является мембранным.

©Метелев Михаил